Les infections à Borrelia ne peuvent être complètement exclues suite à une sérologie négative:

• «En cas d'ELISA, les résultats positifs ou à la limite ont été observés chez seulement 24 patients (53,3%)» (Wojciechowska-Koszko et al., Février 2011).
• «32 patients démontrent des anticorps antiborreliaux spécifiques confirmés grâce à un Western Blot, et ce malgré un ELISA négatif ... Chez les patients présentant des difficultés persistantes, il est nécessaire d'utiliser l’analyse sanguine Western Blot ... La négativité des ELISA est probablement dûe à une très faible production d'anticorps spécifiques causée par l’état de la déficience immunitaire détectée chez tous nos patients. » (Durovska et al., 2010)
• "Le nombre de résultats ELISA positifs IgM et / ou IgG ... variait de 34 à 59% ... La comparaison des immunoblots a donné de grandes différences dans l'accord inter-test ...
  Il est remarquable de noter que certains Western Blot (aussi appelés ImmunoBlot) donnent des résultats positifs au sein d’échantillons testés négatifs par les huit tests ELISA. »(Ang CW et al., Janvier 2011)
  Les laboratoires devraient considérer l’inclusion du «VIsE» (séquence protéique variable exprimée) par rapport aux analyses ELISA et SeraSpot. VIsE décrit l’aptitude de «caméléon» démontrée par Borrelia burgdorferi à constamment modifier sa structure de protéine de surface VIsE in vivo, afin d'éviter d'être identifiée par le système immunitaire. VIsE nous apporte la sensibilité la plus élevée quant aux recherches d'anticorps contre Borrelia burgdorferi.

Le SeraSpot MicroArray analyse les anticorps IgG et IgM de Borrelia burgdorferi listées ci dessous, ainsi que la sous-espèce Borrelia burgdorferi:
(B.b. afzelii), p59 (B.b. garinii), p100 (B.b. afzelii), OspC (B.b. afzelii + B.b. garinii + B.b. sensu stricto), DbpA (B.b. afzelii + B.b. garinii + B.b. sensu stricto).